Details

Title: Разработка и программная реализация нового метода обновления гессиана на сферах для автоматического поиска путей химических реакций: выпускная квалификационная работа бакалавра: направление 03.03.02 «Физика» ; образовательная программа 03.03.02_02 «Биохимическая физика»
Creators: Салманов Вусал Ханлар оглы
Scientific adviser: Рязанцев Михаил Николаевич; Скворцов Алексей Николаевич
Other creators: Каасик Владимир Паулович
Organization: Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Институт физики, нанотехнологий и телекоммуникаций
Imprint: Санкт-Петербург, 2020
Collection: Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция
Subjects: квантовая химия; поверхность потенциальной энергии; ADDF; методы оптимизации; оптимизация с ограничениями; гессиан; координата реакции; quantum chemistry; potential energy surface; optimization methods; constrained optimization; hessian; reaction coordinate
Document type: Bachelor graduation qualification work
File type: PDF
Language: Russian
Speciality code (FGOS): 03.03.02
Speciality group (FGOS): 030000 - Физика и астрономия
Links: Отзыв руководителя; Отчет о проверке на объем и корректность внешних заимствований
DOI: 10.18720/SPBPU/3/2020/vr/vr20-3654
Rights: Доступ по паролю из сети Интернет (чтение, печать, копирование)

Allowed Actions:

Action 'Read' will be available if you login or access site from another network Action 'Download' will be available if you login or access site from another network

Group: Anonymous

Network: Internet

Annotation

Целью данной работы являлась разработка улучшенных методов для автоматического расчета путей химических реакций, основанных на методе следования направлениям ангармонического отклонения на поверхности потенциальной энергии. В данной работе были решены следующие задачи: 1) была разработана и программно реализована схема обновления гессиана при переходе между локальными гиперсферическими координатами; 2) была разработана и программно реализована возможность проведения оптимизации на поверхности потенциальной энергии молекулярной системы во внутренних координатах с наложенными геометрическими ограничениями, что позволило проводить поиск реакций только в реакционном центре молекулы. Полученные методы были верифицированы на ряде тестовых молекулярных систем.

The aim of this project is to develop improved methods for the automatic calculation of chemical reaction based on the method of anharmonic downward distortion following on the surface of potential energy. In this project the following tasks were solved: 1) Hessian update scheme was created and implemented in the transition between local hyperspherical coordinate system; 2) the possibility of optimization on the surface of the potential energy of the molecule system in internal coordinates with geometrical constraints was developed and implemented which allowed to search for reactions only in the reaction center of the molecule. The methods were verified on a number of test molecular systems.

Document access rights

Network User group Action
ILC SPbPU Local Network All Read Print Download
Internet Authorized users SPbPU Read Print Download
Internet Authorized users (not from SPbPU)
-> Internet Anonymous

Table of Contents

  • Введение
  • Литературный обзор
    • Методы поиска стационарных точек
    • Метод ADDF
    • Схемы обновления гессиана
  • Методы
    • Оптимизация в нормальных координатах
    • Оптимизация во внутренних координатах
    • Оптимизация с ограничениями
    • Оптимизация RFO
    • Оптимизация Берни
    • Аппаратное обеспечение
  • Результаты
    • Алгоритмы обновления гессиана при оптимизации в гиперсферических координатах
    • Тестирование методов
  • Заключение
  • Выводы
  • Список литературы

Usage statistics

stat Access count: 5
Last 30 days: 1
Detailed usage statistics