Details

Опухоли, возникающие у носителей наследственных мутаций в генах BRCA1 и BRCA2, характеризуются уникальной чувствительностью к препара- там платины и ингибиторам фермента PARP (poly (ADP-ribose) polymerase). Эффективность препаратов платины и, возможно, ингибиторов PARP, не ограничивается наследственными раками – на подобную терапию отвечает значительное число пациентов со спорадическими новообразованиями. Механизмы подобных ответов связывают с феноменом BRCAness (BRCA-подобность). На данный момент не существует простых, быстрых и открытых тест-систем, направленных на обнаружение BRCA-подобности. Поэтому целью данной работы было разработать методику скринингового определения маркеров генетической нестабильности, выявленных посредством NGS, и проверить гипотезу достаточности триплета маркеров: амплификация гена C-MYC, разрыв 8 и 22 хромосомы для определения присутствия фенотипа BRCA-подобности. В работе было проанализировано 406 образцов ДНК опухолей рака молочной железы с помощью метода цифровой капельной ПЦР. Все образцы были поделены на группы опухолей – ER- и HER2-позитивные, triple-negative breast cancer, BRCA1-ассоциированные – и проанализированы по-отдельности. Данные экспериментов показали, что найденные общие точки интереса, характеризующие генетическую нестабильность феномена BRCAness, не явля- ются определяющими маркерами для скрининга присутствия фенотипа BRCA- подобности. Метод нуждается в расширении, а именно в поиске дополнительных хромосомных аберраций, определяющих генетическую нестабильность феномена BRCAness.

Tumors arising in carriers of hereditary mutations in the BRCA1 and BRCA2 genes are characterized by a unique sensitivity to platinum preparations and inhibitors of the PARP (poly (ADP-ribose) polymerase) enzyme. The efficacy of platinum and possibly PARP inhibitors is not limited to hereditary cancers - a significant number of patients with sporadic neoplasms respond to such therapy. The mechanisms of such responses are associated with the BRCAness phenomenon. Now, there are no simple, fast and open test systems aimed at detecting BRCAness. Therefore, the aim of this work was to develop a method for the screening determination of markers of genetic instability identified by NGS, and to test the hypothesis of the sufficiency of the triplet of markers: C-MYC, chromosome 8 and 22 break to determine the presence of the BRCAness phenotype. In the work, 406 DNA samples of breast cancer tumors were analyzed using the droplet digital PCR method. All samples were divided into groups of tumors - ER- and HER2-positive, triple-negative breast cancer, BRCA1-associated - and analyzed separately. The experimental data showed that the found common points of interest characterizing the genetic instability of the BRCAness phenomenon are not defining markers for screening for the presence of the BRCAness phenotype. The method needs to be expanded, namely, in the search for additional chromosomal aberrations that determine the genetic instability of the BRCAness phenomenon.