Details

Title: Сравнение генетической нестабильности в опухолях BRCA1-зависимого и спорадического рака молочных желез: выпускная квалификационная работа бакалавра: направление 16.03.01 «Техническая физика» ; образовательная программа 16.03.01_06 «Медицинская и биоинженерная физика»
Creators: Загребин Фёдор Альбертович
Scientific adviser: Богомаз Денис Игоревич
Other creators: Октябрьский Валерий Павлович; Преображенская Елена Васильевна, научный сотрудник ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова» лаборатории молекулярной онкологии
Organization: Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Институт биомедицинских систем и биотехнологий
Imprint: Санкт-Петербург, 2021
Collection: Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция
Subjects: BRCA1-зависимый рмж; спорадический рмж; генетическая нестабильность; BRCAness; droplet digital PCR; амплификация гена C-MYC; хромосомные аберрации; BRCA-dependent bc; sporadic bc; genetic instability; C-MYC gene amplification; chromosomal aberration
Document type: Bachelor graduation qualification work
File type: PDF
Language: Russian
Level of education: Bachelor
Speciality code (FGOS): 16.03.01
Speciality group (FGOS): 160000 - Физико-технические науки и технологии
Links: Отзыв руководителя; Отчет о проверке на объем и корректность внешних заимствований
DOI: 10.18720/SPBPU/3/2021/vr/vr21-3880
Rights: Доступ по паролю из сети Интернет (чтение, печать, копирование)
Record key: ru\spstu\vkr\14383

Allowed Actions:

Action 'Read' will be available if you login or access site from another network Action 'Download' will be available if you login or access site from another network

Group: Anonymous

Network: Internet

Annotation

Опухоли, возникающие у носителей наследственных мутаций в генах BRCA1 и BRCA2, характеризуются уникальной чувствительностью к препара- там платины и ингибиторам фермента PARP (poly (ADP-ribose) polymerase). Эффективность препаратов платины и, возможно, ингибиторов PARP, не ограничивается наследственными раками – на подобную терапию отвечает значительное число пациентов со спорадическими новообразованиями. Механизмы подобных ответов связывают с феноменом BRCAness (BRCA-подобность). На данный момент не существует простых, быстрых и открытых тест-систем, направленных на обнаружение BRCA-подобности. Поэтому целью данной работы было разработать методику скринингового определения маркеров генетической нестабильности, выявленных посредством NGS, и проверить гипотезу достаточности триплета маркеров: амплификация гена C-MYC, разрыв 8 и 22 хромосомы для определения присутствия фенотипа BRCA-подобности. В работе было проанализировано 406 образцов ДНК опухолей рака молочной железы с помощью метода цифровой капельной ПЦР. Все образцы были поделены на группы опухолей – ER- и HER2-позитивные, triple-negative breast cancer, BRCA1-ассоциированные – и проанализированы по-отдельности. Данные экспериментов показали, что найденные общие точки интереса, характеризующие генетическую нестабильность феномена BRCAness, не явля- ются определяющими маркерами для скрининга присутствия фенотипа BRCA- подобности. Метод нуждается в расширении, а именно в поиске дополнительных хромосомных аберраций, определяющих генетическую нестабильность феномена BRCAness.

Tumors arising in carriers of hereditary mutations in the BRCA1 and BRCA2 genes are characterized by a unique sensitivity to platinum preparations and inhibitors of the PARP (poly (ADP-ribose) polymerase) enzyme. The efficacy of platinum and possibly PARP inhibitors is not limited to hereditary cancers - a significant number of patients with sporadic neoplasms respond to such therapy. The mechanisms of such responses are associated with the BRCAness phenomenon. Now, there are no simple, fast and open test systems aimed at detecting BRCAness. Therefore, the aim of this work was to develop a method for the screening determination of markers of genetic instability identified by NGS, and to test the hypothesis of the sufficiency of the triplet of markers: C-MYC, chromosome 8 and 22 break to determine the presence of the BRCAness phenotype. In the work, 406 DNA samples of breast cancer tumors were analyzed using the droplet digital PCR method. All samples were divided into groups of tumors - ER- and HER2-positive, triple-negative breast cancer, BRCA1-associated - and analyzed separately. The experimental data showed that the found common points of interest characterizing the genetic instability of the BRCAness phenomenon are not defining markers for screening for the presence of the BRCAness phenotype. The method needs to be expanded, namely, in the search for additional chromosomal aberrations that determine the genetic instability of the BRCAness phenomenon.

Document access rights

Network User group Action
ILC SPbPU Local Network All Read Print Download
External organizations N2 All Read
External organizations N1 All
Internet Authorized users SPbPU Read Print Download
Internet Authorized users (not from SPbPU, N2) Read
Internet Authorized users (not from SPbPU, N1)
-> Internet Anonymous

Usage statistics

stat Access count: 5
Last 30 days: 0
Detailed usage statistics