Детальная информация

Название: Разработка стохастического метода подбора параметров модели геномной селекции: выпускная квалификационная работа бакалавра: направление 01.03.02 «Прикладная математика и информатика» ; образовательная программа 01.03.02_04 «Биоинформатика»
Авторы: Салихов Сергей Рамилевич
Научный руководитель: Козлов Константин Николаевич
Другие авторы: Арефьева Людмила Анатольевна
Организация: Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Институт прикладной математики и механики
Выходные сведения: Санкт-Петербург, 2021
Коллекция: Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция
Тематика: IT-технологии; python; модель регрессии; rr-blup; геномная селекция; фенотип; генотип; разностнаяэволюция; deepmethod; многомерная оптимизаци; IT-technologies; regression model; rr–blup; genomic selection; phenotype; genotype; differentialevolution; multi-dimensional optimization
Тип документа: Выпускная квалификационная работа бакалавра
Тип файла: PDF
Язык: Русский
Уровень высшего образования: Бакалавриат
Код специальности ФГОС: 01.03.02
Группа специальностей ФГОС: 010000 - Математика и механика
Ссылки: Отзыв руководителя; Отчет о проверке на объем и корректность внешних заимствований
DOI: 10.18720/SPBPU/3/2021/vr/vr21-4283
Права доступа: Доступ по паролю из сети Интернет (чтение, печать, копирование)
Ключ записи: ru\spstu\vkr\13936

Разрешенные действия:

Действие 'Прочитать' будет доступно, если вы выполните вход в систему или будете работать с сайтом на компьютере в другой сети Действие 'Загрузить' будет доступно, если вы выполните вход в систему или будете работать с сайтом на компьютере в другой сети

Группа: Анонимные пользователи

Сеть: Интернет

Аннотация

Данная бакалаврская работа посвящена разработке стохастического метода опти­мизации, для геномной селекции.На основе существующих научных исследований был разработан и протестирован стохастический метод оптимизации для подбора параметров модели геномной селекции. В качестве основного алгоритма оптимизации был выбран метод раз­ностной эволюции. Сделана программная реализация метода разностной эволюции на основе проекта с открытым исходным кодом deepmethod. Были реализованы модификации, которые позволяют лучше работать с задачей геномной селекции.Реализованный алгоритм был протестирован функцями Растригина и Швефелаи с использованием реальных данных о фенотипе и генотипе различных сортов пшеницы. Анализ численных результатов показал эффективность и хороший потенциал разработанного метода, при решении целочисленных задач.

Based on existing scientific research, a stochastic optimization method was developedand tested for the selection of parameters of a genomic selection model. Thedifference evolution method was chosen as the main optimization algorithm. A softwareimplementation of the difference evolution method is made based on the deepmethodopen source project. Modifications have been implemented to better deal with the taskof genomic selection. The implemented algorithm was tested with the functions ofRastrigin and Shvefel and using real data on the phenotype and genotype of variouswheat varieties. Analysis of the numerical results showed the effectiveness and goodpotential of the developed method when solving integer problems.

Права на использование объекта хранения

Место доступа Группа пользователей Действие
Локальная сеть ИБК СПбПУ Все Прочитать Печать Загрузить
Интернет Авторизованные пользователи СПбПУ Прочитать Печать Загрузить
-> Интернет Анонимные пользователи

Оглавление

  • Тема выпускной квалификационной работы
    • Список сокращений и условных обозначений
    • Введение
    • 1. Описание использованных методов и данных
    • 2. Разработка программного обеспечения
    • 3. Результаты и их сравнительный анализ
    • Заключение
    • Список использованных источников

Статистика использования

stat Количество обращений: 8
За последние 30 дней: 0
Подробная статистика