Детальная информация

Название: Моделирование шума в каскадах контуров с прямой связью: выпускная квалификационная работа бакалавра: направление 01.03.02 «Прикладная математика и информатика» ; образовательная программа 01.03.02_04 «Биоинформатика»
Авторы: Дэн Суньсиньлэ
Научный руководитель: Руколайне Сергей Анатольевич
Другие авторы: Арефьева Людмила Анатольевна; Дук Мария Алексеевна
Организация: Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Институт прикладной математики и механики
Выходные сведения: Санкт-Петербург, 2021
Коллекция: Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция
Тематика: контура с упрежением(feed-forwardloop); метод Гиллеспи; микроРНК; транскрипционные факторы(ТФ); feed-forward loop(FFL); Gillespie method; miRNAs; transcription factors (TFs)
Тип документа: Выпускная квалификационная работа бакалавра
Тип файла: PDF
Язык: Русский
Уровень высшего образования: Бакалавриат
Код специальности ФГОС: 01.03.02
Группа специальностей ФГОС: 010000 - Математика и механика
Ссылки: Приложение; Отзыв руководителя; Отчет о проверке на объем и корректность внешних заимствований
DOI: 10.18720/SPBPU/3/2021/vr/vr21-874
Права доступа: Доступ по паролю из сети Интернет (чтение, печать, копирование)
Ключ записи: ru\spstu\vkr\13792

Разрешенные действия:

Действие 'Прочитать' будет доступно, если вы выполните вход в систему или будете работать с сайтом на компьютере в другой сети Действие 'Загрузить' будет доступно, если вы выполните вход в систему или будете работать с сайтом на компьютере в другой сети

Группа: Анонимные пользователи

Сеть: Интернет

Аннотация

Цель работы —моделирование стохастического поведения каскадных контуров с микроРНК с помощью метода Гиллеспи,оценка шумовых характеристик контуров, оценка степени влияния вышестоящей микроРНК на работу нижестоящих контуров в каскаде, оценка внешнего шума, сравнение двух типов каскадов. Небольшие контуры с прямой связью хорошо изучены в литературе, однако аналитическое исследование больших контуров, представляет определенную сложность. В результате исследования было показано, что подавить внутренний шум с помощью сторонней миРНК, пришедшей из другого контура невозможно. Более того, она только усиливает внутренний шум в системе.Тем не менее, было показано, что при внесении внешнего шума в систему уровень его в белках меньше чем в ТФ, что доказывает,что каскад подавляет внешний шум,вносимый в ТФ. Вывод:Каскад не подавляет внутренний шум,но подавляет внешний шум.

The aim of the work is to simulate the stochastic behavior of cascade loops with miRNAs using the Gillespie method, to evaluate the noise characteristics of the loops, to evaluate the degree of influence of upstream miRNA on the performance of downstream loops in the cascade, to evaluate the external noise, to compare two types of cascades. Small FFL have been well studied in the literature, but the analytical study of large loops presents a certain difficulty. The study showed that it is impossible to suppress the internal noise with a miRNA coming from another loop. Moreover, it only amplifies the internal noise in the system. Nevertheless, it was shown that when external noise is introduced into the system, its level in the proteins is lower than in the TF, which proves that the cascade suppresses external noise introduced into the TF. Conclusion: Cascade does not suppress internal noise, butit does suppress external noise.

Права на использование объекта хранения

Место доступа Группа пользователей Действие
Локальная сеть ИБК СПбПУ Все Прочитать Печать Загрузить
Интернет Авторизованные пользователи СПбПУ Прочитать Печать Загрузить
-> Интернет Анонимные пользователи

Статистика использования

stat Количество обращений: 7
За последние 30 дней: 2
Подробная статистика