Details

Title: Влияние параметров простейших генных сетей на шум: выпускная квалификационная работа бакалавра: направление 01.03.02 «Прикладная математика и информатика» ; образовательная программа 01.03.02_04 «Биоинформатика»
Creators: Дроздова Дарья Александровна
Scientific adviser: Руколайне Сергей Анатольевич
Organization: Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Физико-механический институт
Imprint: Санкт-Петербург, 2022
Collection: Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция
Subjects: генетическая сеть; основное кинетическое уравнение; уравнение Ланжевена; модель рождения-гибели; gene system; chemical master equation; Langevin equation; birth-death process
Document type: Bachelor graduation qualification work
File type: PDF
Language: Russian
Level of education: Bachelor
Speciality code (FGOS): 01.03.02
Speciality group (FGOS): 010000 - Математика и механика
DOI: 10.18720/SPBPU/3/2022/vr/vr22-2808
Rights: Доступ по паролю из сети Интернет (чтение, печать, копирование)
Record key: ru\spstu\vkr\18843

Allowed Actions:

Action 'Read' will be available if you login or access site from another network Action 'Download' will be available if you login or access site from another network

Group: Anonymous

Network: Internet

Annotation

Тема выпускной квалификационной работы: «Влияние параметров простейших генных сетей на шум». Данная бакалаврская работа посвящена численному моделированию уравнения Ланжевена. На основе существующих научных статей было исследовано основное кинетическое уравнение для химических реакций и его приближение - уравнение Ланжевена. В качестве модели для исследования была выбрана модель рождения-гибели, которую можно рассматривать как приближение простейших генетических систем. Эта модель рассматривалась в трех вариациях: простейшая модель рождения-гибели, модель рождения-гибели с отрицательной обратной связью, модель рождения-гибели с положительной обратной связью. В работе содержатся результаты численного моделирования уравнения Ланжевена для различных параметров модели. Кроме того для простейшей модели-рождения гибели построено точное решение основного химического уравнения. Анализ полученных результатов показал, что уравнение Ланжевена хорошо приближает решение основного химического уравнения.

The subject of the graduate qualification work is «Influence of parameters of the simplest gene networks on noise». This paper is devoted to numerical modeling of the Langevin equation. Based on existing scientific articles, the chemical master equation and its approximation, the Langevin equation, were investigated. As a model for the study, the birth-death model was chosen, which can be considered as an approximation of the simplest genetic systems. This model was considered in three variations: the simplest birth-death model, the birth-death model with negative feedback, and the birth-death model with positive feedback. The paper contains the results of numerical simulation of the Langevin equation for various parameters of the model. In addition, for the simplest birth-death model, an exact solution of the basic chemical equation is constructed. Analysis of the results showed that the Langevin equation approximates the solution of the basic chemical equation well.

Document access rights

Network User group Action
ILC SPbPU Local Network All Read Print Download
Internet Authorized users SPbPU Read Print Download
-> Internet Anonymous

Table of Contents

  • Влияние параметров простейших генных сетей на шум
    • Введение
    • 1. Постановка задачи
    • 2. Обзор и анализ существующих решений
    • 3. Применение уравнения Ланжевена для моделирования простейших генных сетей.
    • 4. Получение и анализ результатов.
    • Заключение
    • Список использованных источников
    • Приложение 1. Создание GUI-приложения для моделирования уравнения Ланжевена

Usage statistics

stat Access count: 10
Last 30 days: 0
Detailed usage statistics