Details

Цель работы - идентификация растения семейства Labiatae – модельного растения-хозяина для поддержания коллекции грибов арбускулярной микоризы.Задачи исследования:1)                  Провести литературный и патентный обзор по тематике;2)                  Освоить методику пересева изолятов АМ-грибов, инокуляцию растительной системы, выращивание растительно-грибного материала для исследований и поддержания коллекции института;3)                  Получить данные результатов секвенирования с помощью прибора Illumina MiSeq почвенных образцов корней растения семейства Яснотковые (предположительный видPlectranthusaustralisR.Br.).;4)                  Произвести сбор растительного материала для молекулярно-генетических исследований, освоить методику, адаптировать и с использованием методики с модификациями произвести выделение ДНК из листьев образца растения; амплифицировать ДНК растения, визуализировать фрагменты амплифицированной ДНК на гель-электрофорезе, произвести очистку ампликонов на силикагеле; провести секвенирование по Сэнгеру по последовательностям ITS, проанализировать полученные данные биоинформатическими методами с использованием базы данных Генбанка;5)                  Произвести повтор генетической идентификации растения, используя другие молекулярные маркеры (рибосомальные гены хлоропластного генома), выявить частоту и спектр мутаций в данных районах у исследуемого образца, используя методы молекулярной филогении представить возможные филогенетические отношения внутри рода Plectranthus, сделать выводы по полученным результатам;6)                  Произвести сбор растительного материала на фазе цветения, произвести морфологическую оценку до вида образца-растения с помощью цветка, сделать вывод о видовой принадлежности растения-хозяина.В ходе исследований проведена молекулярно-генетическая идентификация растения-хозяина, используемого для поддержания коллекции различных штаммов арбускулярной микоризы. Определено, что исследуемое растения относится к новому виртуальному таксону по различным молекулярным маркерам, однако точно выявить вид расстения на данном этапе исследований достаточно сложно и требует детальные морфологическое исследования по генеративному органу.

The purpose of the work is to identificate of a plant of the Labiatae family – a model host plant for maintaining a collection of arbuscular mycorrhiza fungi.Tasks:1) Conduct a literary and patent review on the subject;2) To master the technique of replanting isolates of AM-fungi, inoculation of the digestive system, cultivation of plant-fungal material for research and maintenance of the collection of the institute;3) To obtain data from sequencing results using the Illumina MiSeq device of soil samples of roots of a plant of the clear-flowered family (presumed species Plectranthus australis R.Br .).;4) To collect plant material for molecular genetic studies, master the technique, adapt and, using techniques with modifications, isolate DNA from the leaves of a plant sample; amplify plant DNA, visualize fragments of amplified DNA on gel electrophoresis, purify amplicons on silica gel; perform Sanger sequencing on ITS sequences, analyze the data obtained by bioinformatic methods using the Genbank database;5) Repeat the genetic identification of the plant using other molecular markers (ribosomal genes of the chloroplast genome), identify the frequency and spectrum of mutations in these areas in the studied specimen, using molecular phylogeny methods to present possible phylogenetic relationships within the genus Plectranthus, draw conclusions from the results obtained;6) To collect plant material at the flowering phase, to carry out a morphological assessment to the type of plant sample with the help of a flower, to draw a conclusion about the species of the host plant.In the course of the research, the molecular genetic identification of the host plant used to maintain a collection of various strains of arbuscular mycorrhiza was carried out. It was determined that the studied plant belongs to a new virtual taxon according to various molecular brands, however, it is difficult to accurately identify the type of plant at this stage of research and requires detailed morphological studies of the generative organ.