Details

Title: Устройство пробоподготовки для молекулярно-генетического анализа жидких сред: выпускная квалификационная работа бакалавра: направление 16.03.01 «Техническая физика» ; образовательная программа 16.03.01_10 «Физическая и биомедицинская электроника»
Creators: Коновалова Любовь Витальевна
Scientific adviser: Краснова Надежда Константиновна
Organization: Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Институт электроники и телекоммуникаций
Imprint: Санкт-Петербург, 2023
Collection: Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция
Subjects: пробоподготовка нуклеиновых кислот; микрофлюидное устройство; "мягкая" литография; силиконовая резина; ПЦР в реальном времени (ПЦР-РВ); sample preparation of nucleic acids; microfluidic device; «soft» lithography; silicone rubber; real–time polymerase chain reaction (PCR–RT)
Document type: Bachelor graduation qualification work
File type: PDF
Language: Russian
Level of education: Bachelor
Speciality code (FGOS): 16.03.01
Speciality group (FGOS): 160000 - Физико-технические науки и технологии
DOI: 10.18720/SPBPU/3/2023/vr/vr23-4496
Rights: Доступ по паролю из сети Интернет (чтение)
Record key: ru\spstu\vkr\23950

Allowed Actions:

Action 'Read' will be available if you login or access site from another network

Group: Anonymous

Network: Internet

Annotation

Методы молекулярно–генетического анализа получили широкое распространение в различных областях. Однако, для них требуется пробоподготовка, обычно заключающаяся в лизисе пробы и выделении из нее нуклеиновых кислот. Микрофлюидные устройства позволяют объединить часть или все стадии анализа на одном конструктиве и автоматизировать эти процессы, исключив влияние человеческого фактора на результат. Поэтому целью работы являлась разработка прототипа устройства пробоподготовки жидких сред, предполагающего последующее объединение с устройством для проведения молекулярно–генетического анализа. Было разработано и апробировано два варианта устройства, предназначенных для использования набора реагентов «М–Сорб–ООМ» (ООО «Синтол»). Прототипы устройств созданы из силиконовой резины PlatSet 40 методом «мягкой» литографии с последующей герметизацией кислородной плазмой. Апробация устройств проведена на примере выделения нуклеиновых кислот из клеток E.coli. Продемонстрирована работоспособность второго варианта устройства. Однако, концентрация выделяемых существенных кислот уступает полученной при ручном выделении (пороговые циклы ПЦР–РВ составили цифры и цифры, соответственно). Это, вероятно связано с сорбцией на стенках каналов. Для ее снижения необходим обработать устройство перед использованием, например, бычьим сывороточным альбумином.

Methods of molecular genetic analysis are widely used in various fields. However, they require sample preparation, usually consisting in lysis of the sample and isolation of nucleic acids from it. Microfluidic devices allow you to combine part or all of the analysis stages on one construct and automate these processes, eliminating the influence of the human factor on the result. Therefore, the aim of the work was to develop a prototype of a sample preparation device for liquid media, involving subsequent integration with a device for molecular genetic analysis. Two versions of the device designed for use with the «M–Sorb–OOM» reagent kit (Syntol LLC) were developed and tested. Prototypes of the devices were created from silicone rubber PlatSet 40 by the method of "soft" lithography followed by sealing with oxygen plasma. The devices were tested using the example of the isolation of nucleic acids from E.coli cells. The operability of the second version of the device is demonstrated. However, the concentration of the essential acids released is inferior to that obtained by manual isolation (the threshold cycles of PCR–RV were figures and figures, respectively). This is probably due to sorption on the walls of the channels. To reduce it, it is necessary to treat the device before use, for example, with bovine serum albumin.

Document access rights

Network User group Action
ILC SPbPU Local Network All Read
Internet Authorized users SPbPU Read
-> Internet Anonymous

Usage statistics

stat Access count: 0
Last 30 days: 0
Detailed usage statistics