Details

Title: Компьютерный анализ формы эритроцитов в микрофлюидных устройствах: выпускная квалификационная работа бакалавра: направление 03.03.02 «Физика» ; образовательная программа 03.03.02_02 «Биохимическая физика»
Creators: Иванов Александр Сергеевич
Scientific adviser: Рычков Георгий Николаевич
Organization: Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Физико-механический институт
Imprint: Санкт-Петербург, 2024
Collection: Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция
Subjects: эритроциты; микрофлюидика; машинное обучение; сверточные нейронные сети; противоопухолевые препараты; деформируемость эритроцитов; erythrocytes; RBC; microfluidics; machine learning; convolutional neural networks; anticancer drugs; RBC deformability
Document type: Bachelor graduation qualification work
File type: PDF
Language: Russian
Level of education: Bachelor
Speciality code (FGOS): 03.03.02
Speciality group (FGOS): 030000 - Физика и астрономия
DOI: 10.18720/SPBPU/3/2024/vr/vr24-4562
Rights: Доступ по паролю из сети Интернет (чтение, печать, копирование)
Additionally: New arrival
Record key: ru\spstu\vkr\29811

Allowed Actions:

Action 'Read' will be available if you login or access site from another network Action 'Download' will be available if you login or access site from another network

Group: Anonymous

Network: Internet

Annotation

Данная работа посвящена разработке алгоритма машинного обучения, решающего задачу классификации эритроцитов по принимаемым ими формам в микрофлюидном устройстве. Цель работы: разработать алгоритм машинного обучения, позволяющий классифицировать эритроциты по их геометрической форме. В результате проделанной работы была разработана и обучена сверточная нейронная сеть, решающая задачу классификации эритроцитов по наблюдаемым в микрофлюидном устройстве формам с чувствительностью 0,92 и специфичностью 0,97. Предложенное практическое применение разработанного программного обеспечения показало не только влияние использованных противоопухолевых препаратов (паклитаксел, доцетаксел) на деформируемость эритроцитов, но и позволило наблюдать их индивидуальную реакцию на данные препараты.

This work is devoted to the development of a machine learning algorithm that classifies red blood cells according to the forms they take in a microfluidic device. Purpose of the work: to develop a machine learning algorithm that can classify red blood cells according to their geometric shape. As a result of the work done, a convolutional neural network was developed and trained to classify red blood cells according to the forms observed in a microfluidic device with sensitivity 0,92 and specificity 0,97. The proposed practical application of the developed software showed not only the influence of the used anticancer drugs (paclitaxel, docetaxel) on the deformability of erythrocytes, but also made it possible to observe their individual response to these drugs.

Document access rights

Network User group Action
ILC SPbPU Local Network All Read Print Download
Internet Authorized users SPbPU Read Print Download
-> Internet Anonymous

Table of Contents

  • Перечень сокращений и обозначений
  • Введение
  • Глава 1. Обзор литературы
  • Обзор литературы
    • Физиологическая роль способности эритроцитов к деформации
    • Методы анализа деформируемости эритроцитов
    • Применение микрофлюидных устройств для оценки параметров эритроцитов
    • Машинное обучение
      • Обучение без учителя
      • Обучение с учителем
    • Сверточные нейронные сети
      • Структура сверточных нейронных сетей
    • Применение машинного обучения для оценки морфологии RBC
  • Глава 2. Материалы и методы
  • Материалы и методы
    • Подготовка образцов
    • Изготовление микрофлюидного устройства
    • Постановка эксперимента и анализ видеозаписи
    • Разработка обучающей выборки данных
    • Аугментация обучающей выборки
    • Классификация изображений
    • Статистический анализ
  • Глава 3. Результаты и обсуждения
  • Результаты и обсуждения
    • Результаты обучения CNN
    • Классификация эритроцитов по форме
    • Анализ результатов классификации эритроцитов по форме
    • Обсуждения
  • Заключение
  • Выводы
  • Список использованных источников

Usage statistics

stat Access count: 0
Last 30 days: 0
Detailed usage statistics