Details

Title: Гиперэвристический подход к параметризации моделей в биоинформатике: выпускная квалификационная работа бакалавра: направление 01.03.02 «Прикладная математика и информатика» ; образовательная программа 01.03.02_04 «Биоинформатика»
Creators: Салихов Магомет Салаватович
Scientific adviser: Самсонова Мария Георгиевна
Organization: Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Физико-механический институт
Imprint: Санкт-Петербург, 2024
Collection: Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция
Subjects: гиперэвристика; разностная эволюция; Python; sine-cosine algorithm; rastrigin; DEEP; SCA; EvoHyp; hyperheuristics; differential evolution; deepmethod
Document type: Bachelor graduation qualification work
File type: PDF
Language: Russian
Level of education: Bachelor
Speciality code (FGOS): 01.03.02
Speciality group (FGOS): 010000 - Математика и механика
DOI: 10.18720/SPBPU/3/2024/vr/vr24-5325
Rights: Доступ по паролю из сети Интернет (чтение, печать, копирование)
Additionally: New arrival
Record key: ru\spstu\vkr\30017

Allowed Actions:

Action 'Read' will be available if you login or access site from another network Action 'Download' will be available if you login or access site from another network

Group: Anonymous

Network: Internet

Annotation

Данная бакалаврская работа посвящена разработке гиперэвристического алгоритма для решения задач биоинформатики. Задачи исследования: 1) Изучить различные виды эвристических алгоритмов и способы их создания. 2) Разработать гиперэвристический алгоритм для решения задачи параметризации в биоинформатике. 3) Разработать низкоуровневые эвристики для использования в гиперэвристическом алгоритме. 4) Провести тестирование разработанного метода на задаче оптимизирования параметров модели и провести сравнительный анализ результатов. Существующие исследования послужили основой для разработки гиперэвристического метода, который был реализован с использованием инструментария EvoHyp-python. В качестве эвристических алгоритмов оптимизации были выбраны Sine-Cosine метод, а также метод разностной эволюции DEEP. Произведены тесты разработанного алгоритма на функциях Растригина, и анализ численных результатов подтвердил его эффективность и перспективы в решении задач биоинформатики.

This bachelors thesis is dedicated to the development of a hyperheuristic algorithm for solving bioinformatics problems. Research objectives: 1) Study various types of heuristic algorithms and methods of their creation. 2) Develop a hyperheuristic algorithm for solving the parametrization problem in bioinformatics. 3) Develop low-level heuristics for use in the hyperheuristic algorithm. 4) Test the developed method on the task of optimizing model parameters and conduct a comparative analysis of the results. Existing research served as the basis for the development of the hyperheuristic method, which was implemented using the EvoHyp-python toolkit. The Sine-Cosine method and the Differential Evolution DEEP method were chosen as heuristic optimization algorithms. Tests of the developed algorithm were conducted on Rastrigin functions, and the analysis of numerical results confirmed its effectiveness and prospects in solving bioinformatics problems.

Document access rights

Network User group Action
ILC SPbPU Local Network All Read Print Download
Internet Authorized users SPbPU Read Print Download
-> Internet Anonymous

Usage statistics

stat Access count: 0
Last 30 days: 0
Detailed usage statistics