Details

Данная работа посвящена выявлению клинически значимых транслокаций в образцах опухолей пациентов с раком поджелудочной железы, не несущих мутаций в генах KRAS/NRAS/BRAF. В рамках работы был разработан тест для выявления транслокаций с участием гена NRG1 с помощью ПЦР в реальном времени и оценена встречаемость транслокаций с участием генов ALK, ROS1, RET, NTRK1-3, NRG1 в опухолях поджелудочной железы. На наличие транслокаций было протестировано 109 образцов. Из них было обнаружено восемь образцов с транслокациями, из которых у трех образцов присутствовали транслокации с участием гена ALK (EML4-ALK (E13;A20); COL1A1-ALK (C25;del50A20); GCC2-ALK (G7;A20)), у двух образцов – транслокации с участием гена NRG1 (ATPB1-NRG1 (A2;N2)), у одного образца – с участием гена RET (NCOA4-RET (N7;R12)), у одного образца – с участием гена NTRK1 (GP2-NTRK1 (G3;N8)) и у одного образца – с участием гена  ROS1 (SLC4A4-ROS1 (S24;R34)). Разработанный тест для обнаружения транслокаций с участием гена NRG1 может быть внедрен в лабораторную практику с целью выявления данных аберраций и последующего назначения соответствующей таргетной терапии. Выявление клинически значимых транслокаций генов ALK, ROS1, RET, NTRK1-3 и NRG1 у пациентов с раком поджелудочной железы расширяет возможности персонализированного лечения.

This study focuses on identifying clinically significant gene fusions in tumor samples from pancreatic cancer patients which don’t contain mutations in the KRAS/NRAS/BRAF genes. The work included development of real-rime PCR-based test to detect NRG1 gene fusions and evaluation of the frequency of ALK, ROS1, RET, NTRK1-3 and NRG1 gene fusions in a collection of nucleic acid samples isolated from pancreatic tumors tissues. A total of 108 samples were tested for the presence of gene fusions. Seven fusion-positive cases were identified, including: three with ALK gene fusions (EML4-ALK (E13;A20); COL1A1-ALK (C25;del50A20); GCC2-ALK (G7; A20)), two with NRG1 gene fusions (ATPB1-NRG1 (A2;N2)), one with a RET gene fusion (NCOA4-RET (N7;R12)), one with a NTRK1 gene fusion (GP2-NTRK1 (G3;N8)) and one with ROS1 gene fusion (SLC4A4-ROS1 (S24;R34)). The developed test for the detection of NRG1 gene fusions can be introduced into laboratory practice in order to detect these aberrations and subsequently prescribe appropriate targeted therapy. Detection of clinically significant translocations of ALK, ROS1, RET, NTRK1-3 and NRG1 genes in patients with pancreatic cancer expands the possibilities of personalized treatment.