Details
Title | Разработка пайплайна для поиска потерь и приобретений генов в геномах внутриклеточных паразитов: выпускная квалификационная работа бакалавра: направление 12.03.04 «Биотехнические системы и технологии» ; образовательная программа 12.03.04_01 «Биомедицинские системы» |
---|---|
Creators | Лопатина София Кирилловна |
Scientific adviser | Корнилова Елена Сергеевна |
Organization | Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Институт биомедицинских систем и биотехнологий |
Imprint | Санкт-Петербург, 2025 |
Collection | Выпускные квалификационные работы ; Общая коллекция |
Subjects | геном ; микроспоридии ; редукция генома ; филогенетическое дерево ; ортологи ; cafe ; внутриклеточные паразиты ; proteinortho ; метаболические пути ; genome ; microsporidia ; genome reduction ; phylogenetic tree ; orthologues ; intracellular parasites ; metabolic pathways |
Document type | Bachelor graduation qualification work |
File type | |
Language | Russian |
Level of education | Bachelor |
Speciality code (FGOS) | 12.03.04 |
Speciality group (FGOS) | 120000 - Фотоника, приборостроение, оптические и биотехнические системы и технологии |
DOI | 10.18720/SPBPU/3/2025/vr/vr25-1690 |
Rights | Доступ по паролю из сети Интернет (чтение, печать, копирование) |
Additionally | New arrival |
Record key | ru\spstu\vkr\36868 |
Record create date | 8/22/2025 |
Allowed Actions
–
Action 'Read' will be available if you login or access site from another network
Action 'Download' will be available if you login or access site from another network
Group | Anonymous |
---|---|
Network | Internet |
Данная работа посвящена созданию инструмента для анализа эволюционных изменений, происходящих в результате адаптации к различным условиям, и его применению для исследования облигатных внутриклеточных паразитов, принадлежащих к типу Microsporidia. Эта группа организмов демонстрирует большое количество приспособлений к жизни внутри клетки хозяина: как редукцию многих элементов генома, так и появление специализированных механизмов взаимодействия с окружающей средой, что делает их интересным объектом для поиска геномных изменений с дальнейшим функциональным описанием. Полученные при исследовании протеомов микроспоридий результаты согласуются с результатами, описанными в более ранних исследованиях, а также выявляют семейства генов, требующие дальнейших исследований. Разработанное решение является универсальным алгоритмом, применимым к различным группам родственных друг другу эукариотических организмов, что делает его полезным методом сравнительной геномики.
This work is devoted to the creation of a tool for analysing evolutionary changes that occur as a result of adaptation to different conditions and its application to the study of obligate intracellular parasites belonging to the Microsporidia type. This group of organisms demonstrates a large number of adaptations to life inside the host cell: both reduction of many genome elements and emergence of specialised mechanisms of interaction with the environment, which makes them an interesting object for searching genomic changes with further functional description. The results obtained in the study of microsporidium proteomes are consistent with those described in earlier studies, and also reveal gene families that require further research. The developed solution is a universal algorithm applicable to different groups of related eukaryotic organisms, which makes it a useful method for comparative genomics.
Network | User group | Action |
---|---|---|
ILC SPbPU Local Network | All |
|
Internet | Authorized users SPbPU |
|
Internet | Anonymous |
|
Access count: 0
Last 30 days: 0