Details

Мутации в генах репарации ДНК по механизму гомологичной рекомбинации (HRR) обнаруживаются у 20-30% пациентов с метастатический раком предстательной железы ( РПЖ ). Наличие мутаций генов HRR служит основанием для проведения терапии PARP ингибиторами , чувствительность к которым обусловлена дефицитом гомологичной рекомбинации (HRD) в опухоли . Причины возникновения HRD и роль мутаций в генах , помимо BRCA1/2 , до сих пор не до конца выяснены . Цель работы - оценка присутствия HRD при РПЖ в образцах с мутациями генов HRR и без . Материалы и методы - 578 парных образцов ДНК ( опухоль и нормальная ткань ) исследовались при помощи таргетного секвенирования нового поколения . Результаты - из 93 случаев с патогенными / предположительно патогенными мутациями генов HRR, HRD индекс ≥ 42 наблюдался у 18 образцов , HRD индекс ≥ 25 - у 37. В 485 образцах без мутаций HRD индекс ≥ 42 встречался в 23 случаях , HRD индекс ≥ 25 - в 87. Было отмечено , что индекс HRD при наличии соматических мутаций гена TP53 доверительно выше . Заключение - большинство опухолей РПЖ с мутациями в генах HRR не демонстрирует наличие HRD. Среди опухолей без мутаций HRR, определение индекса HRD позволяет выявить образцы с HRD (4,7–17,9%, в зависимости от порогового значения ).

Mutations in homologous recombination repair (HRR) genes are associated with the development of metastatic prostate cancer (PC) and detected in 20-30% of patients. The presence of HRR gene mutations serves as a basis for therapy with PARP inhibitors, sensitivity to which is due to homologous recombination deficiency (HRD) in the tumor. The causes of HRD and the role of mutations in genes (except BRCA1/2) are still not fully understood. The aim of the study was to assess the presence of HRD in PC in samples with and without HRR gene mutations. Materials and methods - 578 paired DNA samples (tumor and normal tissue) were examined using targeted next-generation sequencing. The HRD score was determined by characteristics of chromosomal instability based on the obtained copy number variation profiles. Results - out of 93 cases with pathogenic/presumably pathogenic mutations of the HRR genes, the HRD score ≥ 42 was observed in 18 samples, the HRD score ≥ 25 - in 37. BRCA2-mutated tumors had a significantly higher HRD score. In samples without mutations (n ​​= 485), the HRD score ≥ 42 was found in 23 cases, the HRD score ≥ 25 - in 87. HRD score in the presence of somatic mutations of the TP53 gene is significantly higher.         Conclusion - the majority of PC tumors with mutations in the HRR genes do not demonstrate the presence of HRD. Among tumors without HRR mutations, determination of the HRD score allows identifying samples with HR-deficiency (4,7–17,9%, depending on the threshold).