Details

Данная работа посвящена созданию надёжного MALDI-TOF MS-алгоритма различения патогенного E. faecium (клада А) и пробиотического E. lactis (клада В). На коллекционных штаммах (89 E. lactis, 36 E. faecium) с помощью прибора UltrafleXtreme (Bruker), программ FlexAnalysis, MALDI Biotyper и многомерной статистики (PCA, кластерный анализ) были определены по 8 видоспецифичных ионных маркеров (m/z) для каждого вида. Впервые для российских изолятов E. lactis выявлены три стабильных спектральных типа (A, B, C), различающихся интенсивностью пиков и наличием уникальных сигналов. На основе этих данных созданы три специализированные базы данных для MALDI Biotyper, проверка которых на тестовой выборке штаммов дала корректную видовую идентификацию, тогда как стандартная коммерческая библиотека MBT Compass все E. lactis ошибочно относила к E. faecium. Результаты применимы в клинической диагностике, контроле качества пробиотиков и пищевом надзоре.

The given work focuses on developing a reliable MALDI-TOF MS-based algorithm for distinguishing pathogenic E. faecium (clade A) from probiotic E. lactis (clade B). Using a Bruker Ultraflextreme instrument with FlexAnalysis and MALDI Biotyper software, 375 mass spectra from 125 strains (89 E. lactis, 36 E. faecium) were analyzed by PCA and hierarchical clustering. Eight species-specific proteomic markers (m/z) were identified for each species, ensuring clear separation. For the first time in Russian isolates, intraspecific heterogeneity of E. lactis was discovered: three stable spectral types (A, B, C) differing in signal intensities and unique high-mass peaks. Three specialized MALDI Biotyper databases were constructed and validated on 40 strains, achieving 100% sensitivity and specificity, whereas the commercial MBT Compass library misidentified all E. lactis as E. faecium. The approach is applicable in clinical diagnostics, probiotic quality control, and food surveillance, offering a rapid, cost-effective, and accurate tool for routine enterococcal differentiation.