Details

Title: Выделение геномной ДНК человека из DryBloodSpotдля диагностики генетических заболеваний новорожденных: выпускная квалификационная работа бакалавра: направление 19.03.01 «Биотехнология» ; образовательная программа 19.03.01_03 «Биотехнология (общий профиль)»
Creators: Березенкова Наталья Викторовна
Scientific adviser: Панкина Илона Анатольевна
Organization: Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Институт биомедицинских систем и биотехнологий
Imprint: Санкт-Петербург, 2023
Collection: Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция
Document type: Bachelor graduation qualification work
File type: Other
Language: Russian
Level of education: Bachelor
Speciality code (FGOS): 19.03.01
Speciality group (FGOS): 190000 - Промышленная экология и биотехнологии
Rights: Текст не доступен в соответствии с распоряжением СПбПУ от 13.06.2017 г. № 91
Record key: ru\spstu\vkr\26360

Annotation

Цель работы – разработать набор для выделения из сухих пятен крови на основе сорбции на магнитных частицах МагноСП-НК-Био (производитель: ГК Алкор Био, Россия). Задачи: 1. Изучение научной литературы по теме работы 2. Подбор оптимального состава набора для выделения из сухих пятен крови на основе сорбции на магнитных частицах 3. Сравнение эффективности выделения из сухих пятен крови относительно выделительных наборов других компаний 4. Апробация набора на большем количестве образцов 5. Анализ полученных результатов В качестве основных методов для разработки набора использовались метод сухих пятен, экстракция нуклеиновых кислот на основе сорбции на магнитных частицах, полимеразная цепная реакция (ПЦР), измерение концентраций методом флуориметрии. При написание литературного обзора использовались следующие базы данных Scopus, PubMed, cyberleninka.ru, nature.com, Elibrary.ru Статистическую обработку экспериментальных данных осуществляли с использованием пакета программ Microsoft Excel Диагностирование генетических отклонений на ранних этапах жизни ново-рожденного помогает своевременно назначить эффективное лечение и предотвратить развитие тяжелых последствий. Метод сухих пятен — это простой и удобный способ хранения ДНК человека и используется для неонатального скрининга. С 31 декабря 2022 года вышел приказ о расширения неонатального скрининга до 36 групп нозологий. В связи с этим, возрастает потребность в возможности автоматизированного выделения ДНК со специальных тест- бланков для последующего анализа. Это поможет упростить процесс работы сотрудников лабораторий и ускорить процесс получения результатов для своевременно-го оповещения о патологиях пациента и назначения корректного лечения.

Research objective: to develop an extraction kit from dried blood spots based on adsorption on magnetic beads MagnoSP-NA-Bio (manufacturer: GC Alkor Bio, Rus-sia) Objectives: 1. Review of scientific literature related to the research topic 2. Selecting the optimum composition of the kit for separation from dried blood-stains based on sorption onto magnetic particles 3. To compare the extraction efficiency of dried blood spots with extraction kits from other manufacturers 4. Testing the kit on more samples. 5. Analyzing the results. The main methods used in the development of the kit were dry spot, nucleic acid extraction based on adsorption on magnetic beads, polymerase chain reaction (PCR) and concentration measurement by fluorescence measurement. Scopus, PubMed, cyberleninka.ru, nature.com and Elibrary.ru databases were used to prepare the literature search. Statistical processing of experimental data was performed using Microsoft Excel software package. Early detection of genetic abnormalities in newborns ensures timely prescription of effective treatments and prevents serious consequences. The dry spot method is a convenient way to preserve human DNA and is used for newborn screening; an order has been issued to extend newborn screening to 36 disease groups from December 31, 2022. As a result, there is a growing need to automatically extract DNA from special test forms and make it available for further analysis. This will facilitate the work of laboratory staff and speed up the process of obtaining results, thus informing them in time about the patients condition and enabling them to prescribe the right treatment.