Details

Целью работы являлось получение чистых культур почвенных ризобиофагов из различных типов экосистем и анализ их морфологических и геномных характеристик, а также их взаимодействий с бактериями–хозяевами – клубеньковыми бактериями S. meliloti. Работа выполнена на базе лаборатории генетики и селекции микроорганизмов ФГБНУ ВНИИСХМ. В результате работы из почвенных образцов двух агроценозов и одного фитоценоза было получено и охарактеризовано 15 чистых культур бактериофагов, инфицирующих клубеньковые бактерии вида S. meliloti. Проведен молекулярно–генетический анализ геномов ризобиофагов, изучены параметры инфекции и литическая активность фагов. Среди ризобиофагов впервые получены и охарактеризованы гигантский фаг миовиридной морфологии и фаг подовиридной морфологии. Показано, что ризобиофаги существенно различаются по специфичности взаимодействия со штаммами ризобий в зависимости от условий культивирования. Для достижения данных результатов в работе были использованы следующие базы данных: eLIBRARY.RU, Scopus, NCBI. Для биоинформатического анализа использовали следующие программы: SPAdes, eggNOG, Proksee, PhageTerm, tRNAscan–SE, PhageScope, PhageGE, BLAST. Статистическую обработку данных осуществляли с использованием программ: Microsoft Excel, PAST.

The aim of the work was to obtain pure cultures of soil rhizobiophages from various types of ecosystems and analyze their morphological and genomic characteristics, as well as their interactions with host bacteria – nodule bacteria S. meliloti The work was carried out at the Laboratory of Genetics and Selection of Microorganisms of the Federal State Budgetary Scientific Institution "All–Russian Research Institute of Agricultural Microbiology". Results: from soil samples of two agrocenoses and one phytocenosis, 15 pure cultures of bacteriophages infecting nodule bacteria of the species S. meliloti were obtained and characterized. Molecular genetic analysis of rhizobiophages was performed, and the infection parameters and lytic activity of the phages were studied. Among the rhizobiophages, a jumbo phage of myovirus morphology and a phage of podovirus morphology were obtained and characterized for the first time. It was shown that rhizobiophages differ significantly in the specificity of their interaction with rhizobia strains depending on cultivation conditions. To achieve these results, the following databases were used: eLIBRARY.RU, Scopus, NCBI. For bioinformatic analysis, the following programs were used: SPAdes, eggNOG, Proksee, PhageTerm, tRNAscan–SE, PhageScope, PhageGE, BLAST. Statistical data processing was carried out using the following software: Microsoft Excel, PAST.