Details

Осенняя, Дарья Игоревна. Адаптация инструмента поиска мутаций в геноме для технологии Spark [Электронный ресурс]: магистерская диссертация: 09.04.01 / Д. И. Осенняя; Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого, Институт компьютерных наук и технологий ; науч. рук. П. Д. Дробинцев. — Электрон. текстовые дан. (1 файл : 2,62 МБ). — Санкт-Петербург, 2016. — Загл. с титул. экрана. — Свободный доступ из сети Интернет (чтение). — Текстовый файл. — Adobe Acrobat Reader 7.0. — <URL:http://elib.spbstu.ru/dl/2/v16-2299.pdf>. — <URL:http://doi.org/10.18720/SPBPU/2/v16-2299>.

Record create date: 12/20/2016

Subject: Вычислительные машины электронные — Применение в биологии и медицине; биоинформатика; геномика; поиск мутаций; bioinformatics; genomics; variant calling

UDC: 004.9:57(043.3)

Collections: Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция

Links: DOI

Allowed Actions: Read You need Flash Player to read document

Group: Anonymous

Network: Internet

Annotation

Данная диссертация посвящена адаптации инструмента поиска мутаций в геноме для его совместного использования с технологией Apache Spark. Описана предметная область, обоснована актуальность инструментов поиска мутаций и необходимость ускорения их работы. Приведён обзор инструментов для поиска мутаций, а также обзор технологии Apache Spark. Разработана и описана методика перевода инструмента поиска мутаций на Spark. Разработанная методика была реализована в инструменте VarDictSpark. Приведены графики сравнения производительности модифицированного и исходного инструментов.

Document access rights

Network User group Action
FL SPbPU Local Network All Read
-> Internet All Read

Document usage statistics

stat Document access count: 145
Last 30 days: 4
Detailed usage statistics