Детальная информация
Название | Моделирование регуляторной сети gap генов: магистерская диссертация: 03.04.02 |
---|---|
Авторы | Наджафи Мождаба Ошнари |
Научный руководитель | Гурский Виталий Валериевич |
Организация | Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Институт физики, нанотехнологий и телекоммуникаций |
Выходные сведения | Санкт-Петербург, 2017 |
Коллекция | Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция |
Тематика | Математическое моделирование; модель экспрессии генов; регуляторные генные сети; дрозофила; эволюция; гены gap |
УДК | 576.895.77:595.773.4(043.3); 519.876.5(043.3) |
Тип документа | Выпускная квалификационная работа магистра |
Тип файла | |
Язык | Русский |
Уровень высшего образования | Магистратура |
Код специальности ФГОС | 03.04.02 |
Группа специальностей ФГОС | 030000 - Физика и астрономия |
DOI | 10.18720/SPBPU/2/v17-4203 |
Права доступа | Доступ по паролю из сети Интернет (чтение, печать, копирование) |
Ключ записи | RU\SPSTU\edoc\45789 |
Дата создания записи | 24.10.2017 |
Разрешенные действия
–
Действие 'Прочитать' будет доступно, если вы выполните вход в систему или будете работать с сайтом на компьютере в другой сети
Действие 'Загрузить' будет доступно, если вы выполните вход в систему или будете работать с сайтом на компьютере в другой сети
Группа | Анонимные пользователи |
---|---|
Сеть | Интернет |
Работа посвящена математическому моделированию эволюцию сети генов gap, которые представляют собой класс генов, контролирующих раннее развитие Drosophila melanogaster. Алгоритм моделирования включал в себя генерацию мутаций в регуляторной последовательности ДНК четырех генов gap, генетическую рекомбинацию и отбор индивидуумов, имеющих устойчивые паттерны экспрессии генов. Экспрессия генов gap для каждого индивида в каждом поколении вычислялась с помощью количественной модели (отображение генотипа в фенотип), которая была построена на основе экспериментальных данных по мРНК и белкам генов gap. Моделировалась эволюция популяции из 100 индивидов на более чем 5000 поколений, в условиях высокой скорости мутаций. Была проанализирована эволюционная динамика влияния на экспрессию (так называемые «регуляторные эффекты») от каждого участка ДНК, который связывает молекулы белков-регуляторов (сайты связывания). Была проведена классификация таких сайтов в соответствии с различными типами динамики их регуляторных эффектов и показано, что в ходе эволюции в регуляторной последовательности ДНК остается меньше сайтов, которые в совокупности становятся сильнее (в терминах регуляторных эффектов). Была вычислена корреляционная матрица, представляющая временные корреляции между регуляторными эффектами различных сайтов связывания. В корреляционной матрице превалируют положительные корреляции, что указывает на преобладание регуляторных компенсаций между сайтами белков-активаторов и сайтами белков-репрессоров. В целом, полученные результаты проливают свет на механизмы возможных перестроений ДНК в ходе эволюции и влияние этих перестроений на регуляцию развития дрозофилы.
Место доступа | Группа пользователей | Действие |
---|---|---|
Локальная сеть ИБК СПбПУ | Все |
|
Интернет | Авторизованные пользователи СПбПУ |
|
Интернет | Анонимные пользователи |
|
Количество обращений: 149
За последние 30 дней: 0