Details
Title | Характеризация нуклеазы PpCas9 из бактерии Pasteurella pneumotropica in vitro и ее применение для праймированного редактирования ДНК: выпускная квалификационная работа магистра: направление 16.04.01 «Техническая физика» ; образовательная программа 16.04.01_10 «Медицинская биотехнология» |
---|---|
Creators | Казалов Максим Алексеевич |
Scientific adviser | Ходорковский Михаил Алексеевич |
Other creators | Октябрьский Валерий Павлович; Федорова Яна Витальевна |
Organization | Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого. Институт биомедицинских систем и биотехнологий |
Imprint | Санкт-Петербург, 2021 |
Collection | Выпускные квалификационные работы; Общая коллекция |
Subjects | Молекулярная биология; Белки; Бактерии; редактирование генома; праймированное редактирование; genome editing; prime editing |
UDC | 577.2; 577.112; 578.81; 579 |
Document type | Master graduation qualification work |
File type | |
Language | Russian |
Level of education | Master |
Speciality code (FGOS) | 16.04.01 |
Speciality group (FGOS) | 160000 - Физико-технические науки и технологии |
Links | Отзыв руководителя; Рецензия; Отчет о проверке на объем и корректность внешних заимствований |
DOI | 10.18720/SPBPU/3/2021/vr/vr21-1902 |
Rights | Доступ по паролю из сети Интернет (чтение, печать, копирование) |
Record key | ru\spstu\vkr\15193 |
Record create date | 10/25/2021 |
Allowed Actions
–
Action 'Read' will be available if you login or access site from another network
Action 'Download' will be available if you login or access site from another network
Group | Anonymous |
---|---|
Network | Internet |
В данной работе была проведена характеризация нуклеазы PpCas9 из бактерии Pasteurella pneumotropica путем проведения экспериментов in vitro. Результаты работ показали активность PpCas9 в разрезании ДНК in vitro. В ходе работ были определены температурный диапазон работы нуклеазы PpCas9, паттерн разрезания ею ДНК-мишеней и требования нуклеазы к РАМ-последовательности (5’-NNNNRT-3’). Также нами была создана форма PpCas9, никирующая ДНК. Охарактеризованный в данной работе белок PpCas9 был использован для создания системы праймированного редактирования генома эукариот, однако созданная система не продемонстрировала эффективности в точном редактировании ДНК клеток человека.
In this work, we characterized PpCas9 nuclease from Pasteurella pneumo-tropica by in vitro experiments. The results of the work showed that PpCas9 is ac-tive in vitro and can introduce double stranded breaks in DNA. In addition, we de-termined the temperature requirements for the PpCas9 nuclease activity, the pattern of PpCas9 DNA cleavage and the requirements for the PAM sequence (5'-NNNNRT-3 ') in vitro. Also we created a PpCas9 mutant form, which nicks DNA. The PpCas9 protein characterized in this work was used to create a system for Prime editing of eukaryotic genome. Unfortunately the created system did not demonstrate the efficient precise editing of genomic DNA in human cells.
Network | User group | Action |
---|---|---|
ILC SPbPU Local Network | All |
|
Internet | Authorized users SPbPU |
|
Internet | Anonymous |
|
Access count: 25
Last 30 days: 0